本次作品加入了组队战的设定：顾名思义，就是每关可以选择两名队员共同作战
アクセル
三角键：特殊攻击
差键：跳越（按住为在空中做一定时间浮游）
方块键：普通攻击
圆圈键：冲刺（在冲刺途中再按一下为翻滚）
ZERO
三角键：特殊攻击键，需取得技能后方可使用
方块键：普通攻击，武器不同连击数也不同
差键：跳越键，可使用两端跳
圆圈键：冲刺（性能要比アクセル的优越）
X
基本和アクセル相同，只是跳越能力差些。但是X的威力不可小视。
全人物共通操作键
START：调出菜单，可调节不同的装备，对人物进行强化
SELECT：提示键。本次新加入的系统。画面的下方不时的会出现感叹号的提示，这时按下SELECT，アイリア会告诉你下一步该怎么办。
L1键：转换视点
R1键：同上（游戏时，画面的右上方会出现2D或者3D的字样，表示这关是以哪种模式来进行的，只有在3D模式下，视点切换键才有效）
L2键：换人
R2键：アクセル和X为切换目标，ZERO为特殊攻击
左摇杆：控制人物移动
十字键：同上
右摇杆：快捷键，切换武器用。（注意：不是按下去）
还新加入变身系统。只有アクセル可以使用。具体方法为：使用アクセル的第一把武器。敌人的最后一击用特殊攻击打死（按三角键），某些敌人会留下一个特殊的能量球，吃掉以后，即可在一定时间里变成敌人的样子。某些特殊的场合需要靠变身才能通过。（BOSS无效）
MISSION 1
アクセル初登场，这一关主要是熟悉一下基本操作。难点只有一处。来到一间房间里，发现前面的门关着，需打掉门上的4个能量珠方可通过。等其中的一个能量珠变成粉红色的时候，快速切换目标，向其射击。连续打3次之后，门便会打开。（注意，其间不能攻击蓝色的能量珠，不然又得重打）出门，遇见ZERO.
MISSION 2
换成使用ZERO
这里大家只需要注意几点：敌人的普通能量弹可以用剑吹飞。巨大的飞行物会放激光和导弹。只需站在它的下方不停的挥刀，很轻易的就可以把它干掉。
BOSS战：一开始往前冲，不要管它，此时攻击无效。跳到下面和アクセル汇合。接着就可以随意的切换队员了。建议使用アクセル主攻，ZERO则负责吹飞BOSS的能量弹。注意BOSS在体力所剩无几的时候会在地面上放出一个巨大的能量球，并且会扩散，需攀延到两边的石壁上，方可躲过。
经过开始的两关考验之后，会出现三个选项
1 选择正式的8个版面中的一个战斗
2 记录
3 退出游戏
在选择版面的界面里，按下R1键可以看到救出的人质数量，以及其所对应的特殊道具和强化芯片。按下L1键可以进行，记录，读取进度，游戏设定等3个选项。
在选定版面之后，还可以自由搭配队员的组合。
游戏攻略部分主要是以营救人质和BOSS战为主的
デイープフォレスト
沿途可以救得3名人质，第4名人质身后有块即将滚落的大石头。需赶紧冲过去在石头还未落下之前将其救出。第5第6个都在活动巨石的上面。第7个悬在空中，需站在最后一块巨石上利用アクセル的浮游能力将其救出。紧接着就是第8个。快速冲上去营救。接着会来到布满尖刺的地方。在第一处尖刺上救得第9名人质。前方不远处悬着第十名人质，同样利用アクセル的能力将其救出。尽头处的尖刺地板上有第11名人质。往前走，在救得第12名人质，跳上前方的平台。营救第13名人质。之后
中BOSS战：8个活动巨石。建议用アクセル，很轻易的就能搞定。（注意当他们落下的时候，地上会有一个影子，不要被压到）
BOSS战：VSストンコング
推荐战法：用ZERO躲避攻击，用アクセル进行远程射击。主要就是和ストンコング拉开距离（注意：他近身的石剑重击威力很大）
过关后习得 アクセル：——ガイアシールド——其作用为；身前出现一面盾牌，可以挡住敌人的部分攻击
ZERO：——狱门剑—— 其作用为：按方块键蓄力，受到攻击后大斩反击
バトルーシプ
开始后可在附近救得3名人质，注意下两边的炸弹手。在尽头处打一架飞机。只要打掉它的两翼即可。推荐アクセル。之后来到另一艘军舰上。先别管敌人。救出左上角的第4名人质。右上方的两个箱子中间有第5名人质。破坏掉前方的墙壁之后，快速救出左方的第6名人质，右方的第7名人质，以及左上方箱子后面的第8名人质（左方的一个突出的箱子后面有——ライフサプタンク——。其用途为：可在途中自由的恢复体力。同前几作）。在尽头处干掉3条机器蛇，场景切换。先营救4周的4名人质（注意：不要让定时炸弹引爆）。前行，中BOSS战：巨型炮台。一定要打掉它下面的所有附炮方可将其击破。它的头部会放出火焰球，用冲刺很难躲避。建议用ZERO的跳越能力，主攻手还是アクセル。场景切换。这儿可以救得4名人质，地形并不复杂。通过尽头处的转换点。BOSS战：VS
ウオフライ 依然是アクセル主攻 ZERO辅助
ウオフライ有以下几种攻击方式
1 中距离使用刀作冲刺攻击。使用アクセル的浮游能力等他剑一过来救移动到他背后，不停的射击（注意：ウオフライ的此招为主攻的招数，多数是连着使用的，应多加熟练アクセル的浮游能力）
2 中远距离使用水柱攻击：因为是呈抛物线攻击，所以只要站在远一点的地方，或者不停的跳越移动即可躲过（别忘了给它几枪）
3 中远距离使用冰柱攻击加导弹攻击：此时应快速换成ZERO，打掉它的导弹。ウオフライ还会不时的用水柱攻击。尽量等它此招出完再用アクセル。
过关后 アクセル习得——フプラツシコレーサー其作用为：半跟踪水柱攻击
ZERO习得——水烈闪——其作用为：使用ウオフライ的武器攻击。普通攻击为三连，特殊攻击为中远距离强力一刀。
コンビナート
一开始的油罐出有一人质，需在定时炸弹引爆前将其救出。在不远处的高台上有第二个人质，可以看得到。用ZERO的二段跳可以救到。前行，来到一即将引爆的桥下快速救出第3名人质。前方的桥下有第4个人质（这里有点难度。建议先不要把版面引出来，也就是不要看到定时炸弹。等到跳跳过上面的红外线装置之后，用冲刺（ZERO）快速通过，救得下面的人质。用同样的方法救得前面的第5个人质（注意：在冲刺途中不要被攻击到，不然时间不够）。在前方的第3条机器蛇初有第6个人质（不要急于射击而误杀了人质）。在尽头处的转换点上方有第7个人质。应站在最近的平台上，使用アクセル的浮游能力将其救出。通过转换点来到中央地带。右上角的两个红外线装置后有第8个人质。前方的两条机器蛇后面的平台上可以救得第9个人质。继续前行。在前方的喷放毒气的铁管上可以得到一个加HP上线的红心。后方的平台上可以救得第10个人质。通过有3个红外线装置的平台。在旁边的一根突出的钢条上救得第11名人质（靠近之后，机器蛇和人质一起出现）。在一处有5个机器人把守的地方救得第12个人质。乘坐尽头处的转换点。BOSS战VSハイエナード
ハイエナード的真身隐藏在巨大木马的上面。并且会不断的放出分身来攻击你。应该先打木马的两条腿，攻击其中的一条，木马会停止不动。再快速切换成另外一条，不停的射击。木马会跪下。然后跳到木马的最上面正面面对ハイエナード。
他会放出两个分身不停的围着你转，而且还会使用火焰攻击，三人合击，以及导弹攻击。真的很难缠。其实抓住他的弱点，很轻易的就可以将其解决掉。
首先找出真身，先使用アクセル的水柱攻击将其定住。然后赶快切换成ZERO使用——水烈闪——的状态。在其召唤分身的时候，也就是攻击无效时间过后（他会先叫一声），按三角键攻击他，ハイエナード又会定住。就这样循环下去知道打败他为止。
PS：如果当中不慎让他跑掉救赶紧换成アクセル使用水柱攻击将其定住，再换ZERO主攻。原因如下
1 アクセル的攻击范围大，但有能量限制，而且威力小。
2 ZERO的攻击范围小，但威力大，而且不消耗能量
过关后アクセル习得——サクルブレイズ——其作用为：火球攻击，击中目标后会扩散、
ZERO习得——爆炎阵——。按R2键使出。使出后，地面发出巨大的火焰阵
トンネルベス
前行，可在右边得到一部机器人。一路上可以救得2名人质。来到一扇大门前，先不要急着进去。往反方向走，在一扇活动门里救得第三名人质之后。按方块键打开那扇大门。左手边有一台机器可以乘坐。在附近仔细搜索一下，有5名人质可以营救。打开右上角的门，两边各有一名人质。破坏掉前方的墙壁，救出第11名人质。进入正前方的活动门，干掉里面所有的机器人（有两名人质可以营救，还有一台机器可以乘坐）。BOSS战VSガンガルン。
先击破他的外壳，建议用アクセル拉开距离射击。基本上第一个形态，攻击速度缓慢，范围又小。根本无力还击。
真身的打法基本同上，只是速度要快了不少。但是它不会远程攻击。只有一招需要注意。就是他的飞腿攻击，一般它在发此招前都会叫一声，小心躲过就是了。
过关后アクセル习得， ——エクスプロージヨン—— 作用为：使用强力的火焰弹攻击
ZERO习得， ]——波断击—— 在使用普通刀的状态下按下三角键，挥出强烈的剑气。
ラジオタワー
往上走。正中央的机器人会不断的放出齿轮，导弹和火球，来危及你和人质的生命。建议用ZERO的冲刺快速通过。这处场景有7名人质。接下来是中BOSS战。使用アクセル或者ZERO的强力武器，朝着BOSS的绿色能量珠方向猛烈攻击，即可。场景切换可在一路上救得9名人质以及一个加HP上限的道具。BOSS战VSデポニオン
用アクセル的エクスプロージヨン主攻。デポニオン的攻击对于已经进行到此关的你来说根本不值一提。但有一点注意，只有当他外壳打开的时候攻击才有效。
过关后アクセル习得——ボルトルネード—— 其作用为：发出巨大的闪电漩涡
ZERO习得——雷神升—— 冲刺途中按下三角键，可以使出伴随着强烈闪电漩涡的升龙剑
并且X加入站队
エアフオス
在附近的飞机处可以救得6名人质。（其中有一架即将坠毁的红色飞机，上去之后先不要急着往左边跳，因为前面会有1名人质，以及一个加HP上限的物品，建议用アクセル取得）接着乘坐尽头处的红色飞机来到巨大飞空艇的外部。先笔直往前冲，打掉两门激光炮台，救到右下角的第7名人质。之后干掉一鸟形机器人。来到飞空艇内部。这里可以救到9名人质（注意：先把敌人引出来干掉。不要把人质先引出来，这里的敌人比较复杂，人质很容易被打死）
BOSS战 VSカラスデイング
カラスデイング有两种攻击模式。一种是在半空中使用飞刀和导弹攻击，飞刀还好对付（冲刺躲避即可）。但是导弹就比较麻烦，这时应换成ZERO切掉导弹。
还有一种就是地面战。因为他的武器比较短，所以ZERO利用水烈闪和他保持一定距离，即可保证安全。注意：カラスデイング会随机使出一招范围极大的飞刀攻击。只有攀延在左右两边的尽头处方可躲过。
过关后アクセル 习得 ——ウイドカツター 回旋镖攻击
X 同上
ZERO 习得—— 双燕舞——使用两把攻击速度极快的小刀作为武器。按三角键可以使出回旋镖
サイバーフイールド
这关的机甲武士需在背后攻击才有效。这里的大部分人质和物品都是需要通过逆转空间来得到的。就是跳入黄色地板上方的光圈里。有几处地方必须变成机甲武士方可通过（变身方法前面有介绍）。
BOSS战VSアリクイツク
他的攻击方式很多，其中还有浮游炮攻击。
基本战法如下：等他停止不动就换成ZERO近身肉搏（一般可以砍到一半以下体力），注意他的浮游炮，可以用ZERO的刀吹飞。
如果他上下移动就换成アクセル用普通攻击追着他打。注意下他的定时炸弹，尽量和定时炸弹保持一定距离。这样你才有机会躲闪。
过关后アクセル 习得——スナイプミサイル—— 可使用半追踪导弹攻击
X 同上
ZERO 习得 ——飞影刃—— 跳越时按三角键，挥出波动。
セントラサーサツト
这关是操作战车，在规定的两分钟之内找齐20个定时炸弹。难点在于一处穿越的地方。左边有两颗定时炸弹，右边有1名人质。（这里必须开两圈，才能完全得到）
BOSS战 VS イプスキー
最弱的BOSS。只需打掉他放出的定时炸弹，他的攻击基本起不到什么作用。用射击系的吧。（不要跟着他跑，很容易头晕。站在中间射击即可）
过关后 アクセル习得——ムービンホイル—— 发出一个齿轮，对地攻击有奇效
X 同上
ZERO 习得 ——斩光轮—— 普通状态下，行走途中按三角键发出一个齿轮
接着会多出一关
パレスロード
这关主要是躲避推车的最终，在尽头处打掉推车即可（建议用ZERO近身肉搏，很简单）
又会多出一关
クリムゾンパレス
BOSS战VSレッド
实力很强的人，不愧是アクセル的老师。对付他只有两人合力了。
首先用ZERO和他近身战。具体方法如下。先切换成水烈闪的状态（别管他的分身，起不了什么作用），跳到真身的旁边。（注意：要正面对着他跳过去，不然会被他的回旋弯刀碰到）接着，逆时针打他。他会不断的投掷手里的弯刀。等他一投完，马上就按三角键攻击他。（主要就是和他的弯刀打个时间差，注意，一定要逆时针攻击，不然会被他的弯刀碰到）大约打个4，5下左右，レッド会换一个地方现身。这时再追过去，重复以上的步骤打他。大约打掉レッド一半以下的体力以后。换成，最好是アクセル的追踪导弹状态，攻击他的真身。每攻击到他一下レッド都会用剑气来反击。这里只要你对アクセル的浮游能力够熟练的话，他伤害不了你。
这样排列队员出场顺序的原因是：レッド的HP越少，他的真身出现的时间也就越短，后期用ZERO根本打不到他。
PS：レッド的气流攻击很是厉害，随时有妙杀的可能。掌握好アクセル的浮游能力是关键
接下来会有两个转移点
随便进哪个都是一样。
进去之后会遇见一些新的敌人。
第二处场景有许多红外线装置。利用アクセル通过
喷火的怪兽用ZERO的水烈闪，一刀一个。
尽头处有8个转换点，玩过前几作的朋友都应该知道，前8关的BOSS都在这8个转换点里面，也就是说，要再一次打败他们。
全部打掉以后，中间会出现另一个转移点。
BOSS战 VSシグマ
很简单，切换成ZERO使用双燕舞的状态。等他一出现就按三角键使用回旋镖攻击他。打到他一下，シグマ就会倒下，接着会在另一处出现。控制得好的话，不用消耗HP
最终BOSS战
不愧为最终BOSS，体力高，攻击方式多。但并不是没有弱点。
不要跳到旁边的平台上，就站在原来的地方守株待兔（详见3,4)
1 BOSS会放4个出绿色闪电球，只要来回不停的移动即可躲过。
2 4个火焰球，只要你是站在当中的部位，前3个都打不到你，只要小心躲过第4个就行
3 近距离喷射火球。这也是攻击BOSS的最好时机。有两种破法，用ZERO的刀进行弹反攻击。但是BOSS只会消耗一点体力，太慢。用アクセル的エクスプロージヨン打他，可谓势如破竹。一回合下来可以打掉BOSS的半截体力（应稍微拉开一点距离，连着火球和BOSS一起打）
4 远距离冲拳攻击。威力最大的一招，而且攻击范围极大。这也是为什么不要大家跳到旁边的平台上去的原因之一了。看清BOSS有一段时间站立不动，说明他要出冲拳了，等他一冲过来就用冲刺往两边躲，接着给他两炮。
打败BOSS结局动画。
二周目游戏的时候，人物所装备的特殊芯片仍然存在
游戏中， X的特殊装甲依然存在，只是被分成了4个部分，隐藏在世界各地（就是关卡中的隐藏的圆形盘状物体）
1 コンビナート
具体位置在第一处场景中，第2条和第3条机器蛇的下面，（旁边可以得到1UP）。进入后X得到装甲的手腕部分，其作用为：特殊攻击可以蓄力
2 デイープフォレスト
具体位置在尖刺地区过后，有两块活动巨石叠在一起的地方。往回跳，在树上。进入后X得到脚部。其作用为：在跳越的时候再按一下差键，可以作长距离滑翔
3 エアフオス
在打完机器鸟之后进入飞空艇内部，有一十字路口。往左走，尽头处就是。进入后X可以得到身体部分，R1和L1键同时按，可以使出必杀技，全屏敌人有效。但只有一次的机会
4 サイバーフイールド
具体位置可以看得到，需要通过逆转空间才可以得到。
进入后X得到头部
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