明尼苏达州超级计算研究所采用新型SGI集群

互联网 | 编辑: 杨雪姣 2007-07-18 18:10:00转载-投稿 返回原文

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美国加州桑尼维尔(2007年5月23日)——位于明尼苏达州大学的数字模拟和高级计算超级计算研究所的计算系统几乎每天都会有数百位研究人员竞争访问。即便是配置了2000颗处理器,但是该研究所还需要不断更新设备才能跟上不断增长的需求。

现在, SGI(NASDAQ: SGIC)新的集群解决方案将有助于确保当前的以及即将出现的处理器紧缺的情况下,不会减慢明尼苏达的科学家和工程师们的工作速度。

预计于本月安装的2048核的SGI® Altix® XE 1300集群将把常见的“提交-等待(submit-and-wait)”研究体验转换到一种交互更多生产力更强的体验。通过将复杂的应用程序在Altix XE集群的数百甚至数千颗处理器之间进行分布,研究人员们将能够更快的完成计算,以更少的时间更多次的重复运行一个问题,并且比以往更快更有效地得出结论。

“对于明尼苏达的科学团体来说,这是一次激动人心的重要采购,”研究所科学计算和应用主管H. Birali Runesha说。“使用Altix XE集群,我们可以将那些以前运行在少数内核上的应用程序的性能增加。现在将更容易扩展任务并实现更快的周转(turn-around)时间。事实上,在1000颗或者更多的内核之间扩展应用程序可能变得很平常。”

对于更多的研究人员来说,这个新的集群将彻底改革他们的生产力。“这一新系统,拥有显著加快的任务周转速度,将能实现我们今天无法完成的研究,” Runesha补充说。

明尼苏达新的Altix XE集群在256颗计算节点上配备了超过4TB的内存,该集群将会推动包括物理、生物学、医学、数学和计算科学等多个领域内的研究,还有工程研究和学术工业协作。

例如,日益复杂的计算流体动力学(CFD)和天体物理学应用现在能够使用非常多的处理器,因此工程师们可以与大学的计算科学和工程实验室里的8英尺*6英尺的投影墙(PowerWall)上显示的模拟情况进行交互。Altix XE集群承担计算工作,并将结果输出给投影墙的显像系统,这样研究人员就可以调整各种参数和设定,他们可以使用一个有超过60亿个单元的网格来模拟一个即将消失的巨星上的氦燃烧壳层上被卷到对流区的没有燃烧的氢燃料。

这种交互带来了新的研究空间,通过多次反复生成新场景,运行批量模拟并实现结果的可视化,科学家们能够以思考的速度而不是等待的速度来体验突破。

“这个集群将帮助明尼苏达的研究人员继续最先进的科学研究,这种研究需要向国家科学基金和其他重要基金来源撰写有力的申请书,”Runesha补充说。“研究人员很快就不会受到资源的限制了”。

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明尼苏达州的Altix XE采用四核处理器

通过SGI及其指定高等教育和科研合作伙伴James River技术有限公司的合作,研究所管理员在对多个提供商的集群解决方案进行评估后,选择了采用了四内核Intel® Xeon®处理器的Altix XE解决方案。从一开始,明尼苏达州大学瞄准了Linux®集群解决方案来解决他们已安装的大规模超级计算机和服务器。“不管你的系统有多大,只要有足够多的用户运行足够多的应用,”Runesha解释说,“它仍然有可能耗尽处理器。”

为了找到最佳效能的解决方案,明尼苏达州大学运行了一个定制的基准测试程序套件以衡量对大多科学和工程应用至关重要的能力。该套件测试了著名软件中使用的功能——例如计算化学的GAMESS(通用原子和分子电子结构系统),和生命科学的BLAST(基因本地排列搜索工具)——还有一些自己开发的代码。该基准测试程序结果显示,与其他双核系统相比,四内核的Altix XE 1300系统实现了出众的性价比,同时对额外设备的需求最小化。

SGI能够在非阻塞拓扑中提供全DDR互联的能力为研究人员提供了一个有力工具。非阻塞解决方案使得多用户和应用使用的系统性能最高。这对研究所来说是一个重要的优势,因为它现在有大约2000个用户。

“在主要研究所中,包括明尼苏达大学,大型共享内存Altix系统都是fixtures,”SGI系统市场部主任Bill Mannel说。“但采用多内核SGI Altix XE集群,即使是最关心成本的研究所也能购买特别的SGI技术、专家意见和技术支持,同时进行第一流的‘向外扩展’集群策略。”水冷的Altix XE集群还降低了已经是计算系统密集环境中的集群拥有和运行成本。“像美国国内其他单位一样,我们的设备即将抵达电力或制冷极限,因此SGI的水冷选项非常吸引我们,”研究所系统和运行部主任Brian RopersHuilman说道。

明尼苏达州大学的系统还通过高带宽的InfiniBand线路实现互联,运行来自Novell®的SUSE® Linux Enterprise Server 10操作系统。SGI Altix XE服务器和集群平台以突破性的价格点提供了出众的性能和能源效率。不像其他集群,SGI Altix XE融合了先进的Intel Xeon处理器系统结构实现了完全工厂集成的集群解决方案和SGI业界领先的服务和技术服务支持。“我们对于这个选择和在明尼苏达州大学安装重量级的Altix XE系统感到兴奋。”James River技术有限公司总裁Tom Mountcastle说。“

过去几年间,明尼苏达州大学一直走在有计划促进研究和缩短发明时间的技术前沿。他们对自己科学社团所需的工具有清楚的了解,Altix XE将为他们的工作做出良好服务。”

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