保税区是一个全封闭、海关全天候监管的特定区域。区内主要有加工企业、仓储企业和贸易性公司共三类企业，分析他们共同接受海关监管和管理的特点，以企业为管理单 位，紧抓货物卡口进出流动，建立企业加工、存储电子帐册。通过项目审批及通关单、入库单、出库单、载货清单的形
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载货清单管理:
当实际货物进出保税区时，每辆车都需要经过卡口的验放登记，而载货清单就事企业进出卡口的凭证
它详细登记了，企业进出卡口的货物明细数量，以及车牌号、集装箱号、封志号等信息。企业需要在载货清单
管理模块录入载货清单，并提交卡口作为验放的依据。
内销补税管理：
该模块用于企业内销的通关单录入申报工作，当加工企业发生料件、成品、边角料和残次品内销时，需要录入内销补税联系单，该单申报给海关后，海关将进行多级审批和定价工作。审批通过后，企业可以用此补税联系单复制生成一份内销通关单，继续进行通关工作。如果审批不通过，企业需要进行修改重新申报。
仓库管理：
仓库管理用于企业入库单、出库单的生成，当企业的通关单经过通关科放行，实际货物也经过卡口进区之后，企业可以根据进区的通关单由系统自动生成一份入库单。在出区通关单经过放行后，就可以生成出库单了。注意：出区载货清单需要根据该出库单生成。另外，系统还提供仓库的综合查询，以及出库单未出区放行的余量的查询。
生产领用和入库管理：
生产领用入库管理包括原料领用管理、产品入库管理和统计查询三个组成部分，在该模块中，企业可以录入原材料的领用情况以及生产线生产出成品后的入库情况。这些出入库数据集中计算后可以产生加工企业的库存数据，便于海关的监管以及企业掌握库存量。
核销申报管理:
加工企业的核销管理包括期初数的录入和申报功能、核销单耗录入申报功能、企业核销试算功能。加工企业可以使用该模块对电子帐册的期初数录入保存并可以向海关申报，在审批通过后，该期初数就可以参与核销了。另外，加工企业在核销前还需要通过本模块向海关申报本期出口成品的准确单耗， 同样经过海关审批通过后，参与到电子帐册的核销。在企业录入完期初数据以及报核单耗后，企业可以使用核销试算功能，让系统计算出核销的结果，这样更有助于企业自身的管理。
仓储业务管理
保税区仓储企业的通关、仓库库存管理全部包含在仓储业务管理模块之中。系统主要提供对仓储企业的
进出区通关、载货清单管理、仓库管理、以及溢短申报、简单加工申报、核销申报等业务的管理。下面对这几个功能分别进行简要介绍：
进出区通关
在仓储企业的保税货物进出区之前，都需要向海关进行报关作业，同时，类似于前面保税加工业务的通关作业，在物流系统内需要仓储企业录入通关单，它同样要求与报关单保持严格的数据一致性，在系统内部也根据南京海关的报关单反馈数据对报关单进行了比对操作。企业使用通关申请模块进行通关单的录入、转发（发往报关行或其他企业）、申报、查询统计等通关业务相关的功能。
载货清单管理
与加工贸易的管理一致，当实际货物进出保税区时，需要经过卡口的验放登记，而载货清单就事企业进出卡口的凭证它详细登记了，企业进出卡口的货物明细数量，以及车牌号、集装箱号、封志号 等信息。企业需要在载货清单管理模块录入载货清单，并提交卡口作为验放的依据。
仓库管理：
仓库管理用于企业入库单、出库单的生成，当企业的通关单经过通关科放行，实际货物也经过卡口进区之后，企业可以根据进区的通关单由系统自动生成一份出入库单。
溢短申报
当仓储企业实际收到货物数量与通关单申报的数量不符时，仓储企业需要向海关申报溢短。溢短数量经过海关审批通过后，系统将更正企业库存的数量。
简单加工申报
当仓储企业的库存商品发生更换包装材料、贴标签、以及拆包、并包等情况时都需要向海关申报简单加工，经过海关审批通过后，系统将更正企业库存的件数等信息。
仓储核销申报
仓储企业入库的货物全部出区后需要向海关申报入库数据的核销，核销审批完成后，入库数据将置核销完标志，同时存档以备以后核查。
库存统计
提供对仓储企业的库存统计、分析功能。可以产生库存清单、库存品名归类清单、库存HS归类清单，等多种报表。
区内转让管理
当保税货物在区内不同企业间发生转让时，需要进行区内转让的申报作业。区内转让发生在以下三种项目类型之间：保税加工、保税仓储、减免税设备。 区内转让的处理流程：由转出方录入转出通关单，录入完成后，发往转入方，转入方确认后提交到海关审批，海关审批完成后，系统自动调整双方的库存。
国内贸易管理
国内贸易管理主要对保税区内的外发加工、区外委托加工、国货进区等加工型业务进行管理，企业利用该模块进行国内贸易项目的备案、变更申请，以及进出区载货清单的录入和国内贸易项目的核销申报，以及相关的数据的查询统计。
减免税设备业务管理
减免税设备业务管理模块提供加工企业以及仓储企业的减免税设备的项目备案、项目变更、以及进出区的通关、区内转让以及出入库操作。还提供相关的查询统计以及报表打印功能。
公众服务
企业可以利用该模块进行进行如下操作：查看海关发布的公告信息，查看政策法规，查看海关发布的政务公开了、办事指南、服务承诺、通关实务、文明服务、廉政规定、监督电话等信息以及下载相关文件。另外，企业可以利用业务问答模块进行业务的提问以及查询。企业还可以在举报信箱模块中匿名发出举报信息，海关相关部门的人员可以在举报信箱查阅。
系统帮助
提供系统的帮助信息、操作指南等内容。可以查看海关发布的文档图表等资料，以及下载相关数据文件。
二、海关端子系统的功能
待办事宜
系统提供一个统一的工作界面，并自动将需要海关人员处理的待办任务显示到该界面上，使得海关人员可以及时方便的了解需要自己处理的业务，从而可以提高业务处理的效率。
加工业务
提供海关对加工业务相关的审批操作、以及查询统计功能。主要包括：保税加工项目的备案以及变更审批、通关单的审批、内销补税审批定价、原料领用产品入库的查询统计、电子帐册的期初数和报核单耗的审批、以及帐册核销，以及项目的查询统计功能和加工企业的库存统计功能。
仓储业务
提供海关对仓储业务相关的审批操作、以及查询统计功能。主要包括：仓储通关单的审批、溢短的审批、简单加工的审批、仓储核销的审批、以及仓储企业的库存查询统计功能。
减免税业务
提供海关对减免税设备项目审批、通关单审批操作、以及相关的查询统计功能。
国内贸易业务
提供海关对外发加工、区外委托加工、国货进区相关的审批操作、以及查询统计功能。
风险布控系统设置
该模块可以对系统进行风险布控设置，海关可以针对不同的项目类型、不同的企业进行布控，改变审批需要的流程和步骤。主要包括项目审批级数，不同通关单的审批控制，项目过期未核销，项目超期未开展业务，项目金额倒挂，海关三级单耗的控制，卡口验放控制，仓储出货件数控制等。
公众服务
企业可以利用该模块进行进行如下操作：查看海关发布的公告信息，查看政策法规，查看海关发布的政务公开了、办事指南、服务承诺、通关实务、文明服务、廉政规定、监督电话等信息以及下载相关文件。另外，企业可以利用业务问答模块进行业务的提问以及查询。企业还可以在举报信箱模块中匿名发出举报信息，海关相关部门的人员可以在举报信箱查阅。
系统帮助
提供系统的帮助信息、操作指南等内容。可以查看海关发布的文档图表等资料，以及下载相关数据文件。
三、系统后台辅助服务程序的功能
系统后台的服务程序，主要包括南京报关单数据下载比对、系统监控预警、系统数据优化有效性检测和备份、海关标准参数导入程序。 (供应厂商：神州数码)
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