曙光5000A高性能计算机是国家863计划高性能计算机及其核心软件重大专项支持的研究项目，是面向网格的高性能计算机，可以为网格提供计算服务，同时也是面向信息服务的超级服务器，可以提供多目标的系统服务。
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曙光5000A系统峰值运算速度达到每秒230万亿次浮点运算（230TFLOPS），LINPACK运算速度超过每秒160万亿次浮点运算，是目前国内速度最快的商用高性能计算机系统。曙光5000A使中国成为继美国之后第二个能制造和应用超百万亿次商用高性能计算机的国家，也表明我国生产、应用、维护高性能计算机的能力达到世界先进水平。该系统在大规模机群计算和网格使能技术方面有所突破，形成了鲜明的技术特色，将我国通用高性能计算机系统的研制水平提升到一个新高度。
（1）突破230万亿次峰值运算能力
曙光5000A采用国际高性能计算机主流的机群结构，整个系统规模达到1650个节点，每个节点为4CPU的4核SMP系统，采用AMD Barcelona 2.0GHz处理器，峰值运算速度为230TFLOPS。整个系统通过两套网络互连，包括Infiniband、千兆以太网。系统的主要配置如下：
230T FLOPS峰值运算速度
6600个CPU
1650个结点
100TB内存
700TB存储
两套互联网络
曙光Gridview机群软件
（2）高密度
对于大规模高性能计算机系统而言，如何提高系统密度并降低功耗是研制人员面临的关键问题之一。为提高曙光5000A的系统密度，中科院计算所联合曙光公司，研制了具有自主知识产权的4CPU 4核高密度刀片主板和基于该主板的世界上第一款7U高度的10片4路4核64位CPU的工业标准刀片服务器。该刀片服务器可以实现单机箱40CPU，160核的超高计算密度，并实现了单节点内部的并行计算。
（3）全自主
中科院计算所联合曙光公司自主设计了包括主板，体系结构，刀片服务器，刀片机箱系统，网络交换系统，水冷散热系统在内的全部系统。曙光5000A的设计也完全符合中国刀片服务器标准。在自主创新的研制过程中，曙光在业界实现多个第一：
首次实现了4路16和的高密度刀片系统，
首次实现了单刀片机箱40克CPU的高密度机箱设计，
首次实现了基于DDR的Infiniband的交换结构，实现了20GB高速互联和小于1.3us的低延迟。
首次采用了水冷散热系统，降低了高性能计算机对机房系统的要求，降低了系统功耗。
（4）高效能
由于采用高密度服务器，曙光5000A能大约75平方米的占地面积内聚集230万亿次的计算能力，而其满负载运行时不带水冷系统功耗只有700千瓦，代水冷系统的功耗仅为1000千瓦。这一方面提高了机群系统的可扩展性，另一方面降低了整个系统地运行成本。
（5）高速互联
曙光5000A采用基于DDR的 Infiniband高速网络实现计算网络和存储网络合一。实现了20GB的节点间传输速度，实现业界最快的小于1.3us延时。
（6）应用广泛
曙光5000A不仅可以应用于高性能计算，还可以应用于信息服务，电子政务，网络游戏等常见商业应用。
在高性能计算领域，曙光5000A可广泛运行证券指数计算、电力安全评估、建筑工程抗震性评估、天气预报、石油地震资料处理、核能开发利用、汽车碰撞、电磁辐射、计算流体力学、基因匹配与拼接、蛋白质结构分析和材料科学等20多个应用领域。
在商业应用方面，由于曙光5000A使用Suse Linux 和 WCCS ，可广泛运行目前Linux和Windows下的主流的行业软件。
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