在试运行阶段，高性能计算中心联合校内的多家相关研究单位，针对一些成熟的高性能计算应用课题做了初期联合测试，测试结果达到预期性能指标
目前，高性能计算中心在前期调研的基础上，部署了许多应用软件，涉及大规模非线形复杂系统的计算和模拟、有限元计算、流体动力学计算模拟、分子动力学计算及力场模拟、计算化学与药物筛选等领域，校内用户已可通过网络远程登陆并提交相关计算作业。
云大高性能计算中心副主任李汉斌表示：“我们也曾尝试过自己搭建集成系统，但十分不稳定而且速度慢，这次采用曙光4000A机群服务器，稳定性非常好，到目前还没有出现过宕机现象，并且速度也明显提高了好多倍。曙光4000A机群系统的引入有效地解决了云大在材料科学、生命科学、大气科学等学科基础研究上的高性能计算应用需求，同时也为云南各行各业科学研究和经济建设提供了良好的服务。”
为了更好地推动高性能计算在云南省科学研究与经济建设中的应用，进一步提高云南省科技创新能力，为云南省培养高性能计算研发和应用方面的高层次专门人才，云大高性能计算中心先后与中科院计算所、上海超算、曙光、 AMD、中科院昆明植物所以及上海药物所等多家单位建立了全面的合作关系，相继成立上海超算云南大学分中心、云南大学-中科院计算所高性能计算联合实验室、云南大学-曙光公司高性能计算技术支持中心、AMD64高性能计算教学科研实验室等多个研发平台，为推动云大深入开展高性能计算的教学、科研和应用奠定了良好的基础。
曙光公司销售总监王成江表示，随着机群技术的日渐成熟，机群服务器已经教育城域网、高校信息化和教育科研网格建设中得到广泛青睐。在西部四十多所高校校园网，北京、烟台、上海、南阳等地城域网以及中山大学、北京邮电大学等重点高校的教育科研网格项目中，曙光机群服务器中的TC1700、曙光3000以及最新一代的曙光4000系列机群服务器实现了广泛部署。云南大学高性能计算中心的建立和曙光4000A的成功运行，对西南地区高性能计算应用将起到非常好的示范和辐射效应，带动其他行业通过高性能计算来提升业务效率和科技竞争力。
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