免费并不意味着便宜
成本因素在IT部门决策过程起着至关重要的角色，这显而易见。但是即使开源系统是免费的，也不能说它在成本问题上就是板上钉钉的获胜者。
虽然企业用户在购买Linux时支付的初始成本较少，但是因为操作系统成本仅占TCO（Total Cost Ownership，总体拥有成本）的3.8%，用户未必能通过应用Linux来降低企业的整体拥有成本。
在Menasha公司，选择使用Linux使得他们可以使用低价的计算机硬件。但是与此同时，他们却又不得不雇用了专家级别的技术人员来支持他们所选择使用的这个系统。
因此，对有的公司来说，选择开源系统可能意味着对外来技术支持的更大依赖性。这意味着公司要投入更多的维护时间和维护成本来支撑这个系统的正常运行。
对企业来说，操作系统所带来的成本不仅仅在于操作系统本身的价格，还包括：人员成本、学习成本和后续开发。对于Linux来说，第一是Linux工程师普遍工资水平较高，而用户在Linux方面技能和经验还需提高，因此每年需要更多的外包服务费用；第二是目前用户在Linux系统方面技能和经验还非常有限，学习成本也大大增加；第三就是操作系统相关的内部开发成本很高，尤其在应用、数据库服务器方面。
这也是很多人为什么推荐使用微软的解决方案的原因。
不选最贵的，只选合适的
当企业在开源系统和一个商业软件之间为了到底选择谁而拿不定主意的时候，可以从以下几个方面考虑一下：所有权成本、支持成本、兼容性和员工能力等。
当你在购买任何软件前，你应该首先考虑一下使用者对其的评价，开源系统通常需要使用者投入更多的精力来学习如何使用它。也可以通过互联网看一下使用过这个系统的人的经验之谈。可以提出一些问题，看看得到支持的准确性和及时性如何，另外，确认一下这个系统可以与公司的其他应用是否可以兼容。
从IT的角度来看，通常部署来自微软的解决方案所遇到的麻烦会小的多，因为它的各个产品可以很好地一起协同工作。
Poland表示，“假若你只是想在一个低端硬件上运行一个数据库，你可以把目光只放在软件本身，但是如果你部署的是一整套系统，那么你要确保至少有一个人非常了解各个子系统之间交互工作的原理，假若你肯通过多花钱来减少熟悉的时间和精力的话，你可以考虑选择微软。”
Nelson表示，在Plan Administrators公司之所以选择继续使用Windows而不是转向Linux，不仅仅是受员工的影响，还有其他所有的相关因素。他表示，“那时候，我认为开发者所掌握的技能更倾向于Windows而不是Linux，因此最终选择了Windows。”
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