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“与以往的HPC基础构架相比,在体系构架、通用性和面向用户的性能方面,LRZ的SGI新一代超级计算机都具有明显优势。它为LRZ提供了一个从桌面到顶级HPC系统的统一的计算环境。通过为德国提供世界一流的计算性能,这一强大的新资源将提高该地区的竞争力。实际上,有了这一新的SGI Altix 系统,我们就能够角逐欧洲超级计算系统的竞争。”–LRZ董事会主席H.-G. Hegering 博士/教授
对于慕尼黑莱普尼茨计算中心(LRZ)的科学家们来说,实现理论上的计算性能不再仅仅是一个故事。对于他们——也对于整个巴伐利亚、德国和欧洲的众多用户来说,问题是——德国的新的国家超级计算机将如何帮助他们解决今天最令人望而生畏的科学问题。
因此,作为欧洲科学团体的一个里程碑,LRZ开始了它大规模SGI Altix 4700超级计算的第I阶段的安装工作。这一新的64位Linux 刀片系统配备了4096颗Intel Itanium 2处理器,采用了17TB的全局可寻址内存,它无异于是德国的一个国家财富。
“选择该系统的关键标准并不是一个抽象的最佳性能数值,”LRZ高性能计算(HPC)部门的负责人 Horst-Dieter Steinhöfer博士说。“最高标准就是在运行解决重大科学问题程序的实际混合负载时获得的持续性能,这些负载会让较小的系统超出负荷。有了这些条件下,可以预料我们新的LRZ国家超级计算机将成为世界上最强大的系统之一。”
对于那些解决物理学和天文学、材料研究、流体动力学、化学、地球科学和生物科学领域里日益复杂的仿真问题的研究人员们来说,这个新系统可以节省时间:获得结果的时间、解决问题的时间和进行创新的时间。
在2006年11月的排名中,LRZ超级计算机果然以26.2 TeraFLOPS的最佳性能排在了世界500强超级计算机的第18位。
“SGI的NUMAflex平台在6项应用程序基准测试中的5项里,获得了所有被测系统的最高性能。并且在总体性能的累计方面遥遥领先。我们还检查了内部通信和I/O性能。在这些方面,SGI Altix 再次证明了自己是一个一流的平台。SGI机器在整个基准测试组合方面都最具竞争力。它可以很好的扩展,并且预留了非常灵活的使用性。” –LRZ的Matthias Brehm博士/教授
灵活强大并且操作简单
该系统的用户之所以能够获得时间节省,部分原因在于SGI Altix 系统具有令人瞩目的灵活性。Altix系统可以运行下列程序:
• 为分布式内存体系结构而编写的程序(MPI代码),让用户可以访问多达4000颗处理器;
• 为共享式内存体系结构而编写的程序(OpenMP代码),在共享内存模式下,现在最多可以访问256颗处理器,并且可以根据需要增加计划(planned as needs warrant);
以混合代码表些的程序,采用两种体系结构的灵活组合。
LRZ的管理员们认为随着并行应用代码的编程变得更加容易,Altix系统将帮助研究人员们在所有的应用领域内实现创新突破。
例如,可以参考天文物理学和流体动力学研究人员的情况。他们从工作的开始就使用超级计算机,生成一些我们曾经见过的最为复杂的并行处理任务,并且他们也因此精通如何最大利用一台超级计算机。但是,对于也被广泛用于其他科学学科中的世界一流的HPC资源来说,用户需要一个用户友好的超级计算环境。
幸运的是,共享内存SGI Altix 平台提供了这种可用性。例如,访问一个海量主存池,可以让基因和蛋白质研究人员能够完全在内存中保存海量数据库。单单就这一项功能就可以为计算任务带来极大的加速,原因就在于系统不需要访问磁盘存储器就可以获得数据了。
组成LRZ的SGI Altix 4700系统的节点每个都有256颗处理器,在一个单个Linux实例下运行时该系统最多可以扩展到1024颗处理器。这一成绩是Linux可扩展性的新记录,实际上是由SGI在LRZ自己运行Novell 的SuSE Linux企业版10的系统上实现的。由于用户要求更大的单个系统映像配置,LRZ计划将一个或者多个节点扩展到512颗处理器,也可能某一天扩展到1024颗处理器。
“选择该系统的关键标准并不是一个抽象的最佳性能数值…最高标准就是在运行那些会让较小的系统超出负荷的用来解决重大科学问题的程序的实际混合负载时获得的持续性能。所以,可以预料我们新的LRZ国家超级计算机将成为世界上最强大的系统之一。”
–LRZ高性能计算(HPC)部门的负责人 Horst-Dieter Steinhöfer博士
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