某天，晋升为地球连邦军少尉的〔古罗德〕，终于接到他第一个任务．在惑星〔密诺基尼亚〕的谜之能量被发现后。为了调查此事，古罗德就和派遣队向宇宙进发。他以父亲〔洛尼基斯〕提督的护卫身份乘上战舰。
正章末尾剧情
众人转移来到一小屋 ，这时会遇见动物学家罗艾路，从对话中得知西方的洞穴有野生沙利兽居住。跟著来到西方的红水晶洞穴，途中会拾得记者芝沙特的记者证。在底层会看见沙利兽被怪物袭击，击退他们后，成功获得沙利兽，选第一行令罗艾路加入。接著众人乘著沙利兽飞回比斯多拉路市，和市长谈话后得知约想打败十贤者，就必先取得四宝珠的力量才可，而它们的位置是∶北方的知之场，西北的力之场，东北的爱之场和东南的勇气之场。及后众人便立刻起行，向著北方五角岛的知之场出发。
这时不必那么心急，既然来到新地方，当然要四处游览一下吧。来到比斯多拉路市上方大厦的三楼，将记者证还给芝沙特，选第一行令她加入〔在这里进行ＰＡ会在芝沙特处探得比斯多拉路市的秘密情报〕。在西北方的雪地城市进行ＰＡ，到上方的罗艾路家会看见其徒儿。接著玩者可到东方的游乐场玩玩〔这里进行ＰＡ会在右边的占卜店遇见莉娜〕。最后来到东南方的亚雾洛古之街，这里的武器相当强劲，有钱的话便将所有买下吧〔进行ＰＡ会在右边看见亚梳多想约女仔，而到宿屋二楼会被佩莉斯戏弄〕。
每处也逛过后〔这时玩者应已贮齐七名同伴〕，众人来到知之场。这处要先开启所有开关，最后在中间会出现转移点。进入最后房间，当然是打ＢＯＳＳ的时候了。这场战斗只要不断用魔法攻击便可。战胜后取得智慧之宝珠。休息过后，便去东北方雪山上的力之场〔带备多些药物补给〕。这里会发现一些大星星阻路，由于每场战胜也有五万多大元，所以将它们全数击倒吧。接著众人来到山顶木桥，过桥时会被守护机械人阻拦，战斗立刻展开。这场仗不易打，狂攻击破它的第一形态后，它会变成只得上半身的状态，这时下命令叫所有人远离，因她会作原地广范围攻击，绝对不能埋身肉搏，只要不断在旁边作魔法攻击才能将其击倒。胜利后过对面，成功取得力之宝珠。
下一站是东南方的勇者之场。入内进入由左边数起第二条通道，顺著经右，左，上，左会来到一特别房间，上台拿勇气之象后便回入口处。跟著行右，右来到另一特别房间，选第二行放置勇气之象后会转移到ＢＯＳＳ房间，这次又是打守护机械人，用同样方法将它收拾。取得勇气之宝珠后，便去最后一站，位于世界中央的浮游岛～爱之场。乘沙利兽落下，途中要按掣将通道连结。在尽头应战女魔法师，战胜后取得爱之宝珠。接著回比斯多拉路市禀告市长，他说已召集了防卫军，决定攻打十贤者的大本营。
接著众人来到拉古亚基地，乘上深海探查生物．顺利通过外围障壁，进入黑暗塔。入内会发现十贤者正等待著。他们为了显示实力，不断开炮攻击洛尼基斯的战舰。一轮猛烈炮轰下，终于抵挡不住而被击沉了。古罗德忿怒之下上前应战，但事与愿违，结果又再次惨败。这时防卫军队长上前阻挡十贤者，叫古罗德等人马上撤退。为了大众著想，各人立刻途回比斯多拉路市。回到后，市长说能令众人返回过去，能回到昔日的密诺基尼亚，叫众人前去亚雾洛古之街的纹章兵器研究所看看。于是来到亚雾洛古之街，开启上方的封印之门后，众人会转移到一森林内。接著进入上方的破旧研究所，在里面市长会说这里设有时空转移装置，更说在七亿年前这里曾受十贤者破坏，而管长的女儿莉娜在爆炸前被时空转移逃走了，那么现在的莉娜即是七亿年前的人，真是令人惊讶！
及后众人出去回到亚雾洛古之街，到中间的屋子找美拉祖博士。他说已研究出对抗十贤者的反阳子兵器，现在只欠缺矿石能源，于是众人便立刻赶往附近的美利洞穴。乘沙利兽到达后，这里的敌人魔法攻击很强〔最好每场战斗也先提升魔法防御力〕，要小心。在尽头处打ＢＯＳＳ～矿石兽，及后获得特殊矿石。拿矿石回去给美拉祖博士，他说要用三日时间来完成，叫众人到游乐场玩玩。于是便来到游乐场的斗技场进行特训，完事后选第三行，这时会有助手送来对抗十贤者的强劲武器，接过后会与两名十贤者战斗。战胜后赶回亚雾洛古之街，会发现美拉祖博士被袭击，接著决战第三位十贤者。胜利后众人回比斯多拉路市商议对策。
会议结束，古罗德等人决定和十贤者力拼，市长叫众人到拉古亚基地集合。故事来到这里已是最后阶段〔建议将各人的ＬＶ提升至⒏０或以上〕，到游乐场进行ＰＡ，会在左边发现负伤的防卫军队长，送了去救治后会取得一些道具。一切准备完毕后，便来到拉古亚基地。到右边的治疗室和市长谈话后，便等待明天出发，古罗德和莉娜渡过了浪漫的一晚。翌日，美拉祖博士会给与莉娜〔结界纹章〕以防十贤者会使出〔崩坏纹章〕令全宇宙毁灭。
众人再次乘深海探查生物向著黑暗塔出发。入内会有三位十贤者在等待著，战斗除即展开。战胜后往上行，在五楼会遇见另外两名十贤者，此战要先为各人装备加强火性防御的指轮或宝石，在战斗开始时要先加强魔防。胜利后继续前进，在七楼处要迎战第九位十贤者～路斯夫路，此战只要为各人装备加强风性防御的指轮或宝石便不难应付。打败他后，继续往上走，途中经第九层落回八楼，再上三次直楼梯会来到最后ＢＯＳＳ房间，与最后的十贤者～加夫利路作最终决战。由于这个是最后ＢＯＳＳ，所以实力非常强劲〔建议将ＬＶ提升至⒐０或以上才有胜算〕，先为各人装备加强全属性防御的饰物〔在之前战胜的十贤者时会取得〕，一定要派莉娜和些莉露出场。在开始时加强魔防，能力和移动速度，这样很快便可战胜第一形态。接著进入第二形态，由于他的速度会增快很多，所以要不断以魔法攻击来协助，同时亦要注意他的强劲魔法，一被减血便要立刻回复，不能犹豫！一轮激战后，终于将加夫利路打败了。他在临死时启动了崩坏纹章，于是莉娜便用结界纹章破解它。但震动仍未停止，市长说原来结界纹章只是将毁灭全宇宙的力量集中到新利笛大陆处。这时开始爆炸，市长利用时空转移将众人送回毁灭前的密诺基尼亚惑星，及后各人回到自己的故乡，休闲地生活．．．．．．
真•ガブリエル的出现方法（最终BOSS）
方法1：
在第9层的SAVE点存盘后，若在クリク看过フィリア的PA，则回到セントラルシティ会有重要PA，“フィリアの愿い”。完成这个PA后最终BOSSガブリエル将强化为真•ガブリエル。
方法2：
在纹章兵器研究所得到アクセスコード后，就可以解开ノースシティ图书馆内的全部秘密资料。
1.满足全部チサト加入的条件，去跟チサト对话。（这时不让她加入也可以）
2.去ノースシティー的图书馆调查シークレット情报，得知需要密码。
3.去ギヴァウェイ的大学，从学长パレル那里得知レイファス在进行奇怪的研究。
4.在大学里找到レイファス，反复对话得知他想要情报机关的情报。
5.去セントラルシティ找チサト（チサト是同伴的话进行PA，不是的话不用PA），拜托她调查破解ノースシティー的电脑程序的方法。
6.再用上面的方法找チサト，直到得到密码。
7.去ノースシティー的图书馆，输入密码，シークレットファイル启动。
8.得到アクセスコード后，跟レイファス对话，即可解密一部分情报。
9.跟学长パレル对话，得到パンドラボックス。
10.再去找レイファス，开始进行最终解析作业。
11.出城转一圈，再去找レイファス即可解密所有情报。
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